Zastosowanie technologii mikromacierzy

Konstrukcja bibliotek cDNA jest przydatna do poznania ekspresji genów w organizmach w róznych warunkach, ale losowe sekwencjonowanie bezstronnych cDNA jest pracochlonne i prowadzi do redundancji. Naszym celem bylo wyizolowanie cDNA indukowanego przez przestawienie Aspergillus nidulans z glukozy na wybrane polisacharydy. Opracowalismy metode hybrydyzacji z negatywna subtrakcja, która polegala na przesiewaniu biblioteki utworzonej z cDNA komórek hodowanych w wybranych warunkach fizjologicznych ze znakowanymi sondami cDNA z innych warunków fizjologicznych. W badaniach przesiewowych w poszukiwaniu transkryptów indukowanych zmian± Lródla wegla wyizolowano 3532 negatywy. Wykonano jednokanalowe eksperymenty mikromacierzowe, aby potwierdzic, ze wiekszosc negatywów byla rzeczywiscie indukowana w sposób zróznicowany. Aby uzyskac wglad w regulacje, uzylismy mikromacierzy do identyfikacji zmian ekspresji genów po zmianie zródla wegla z glukozy na pektyne lub po glodówce glukozowej. Wyniki tych badan ukazuja uzyteczne wykorzystanie poteznej technologii mikromacierzy do badania profilowania ekspresji genów w róznych warunkach fizjologicznych.