Mikrobiologia metaboliczna, wirusologia i retrowirologia

Metabolizm czowieka i zmiany klimatyczne mog modulowa ewolucj superbakterii i pojawiajcych si wirusw. Bonnik pokarmowy i ludzkie leki - antybiotyki i nieantybiotyki - mog modulowa flor jelitow, powodujc wzrost kolonii i endosymbioz, powodujc zmiany klimatyczne, ewolucj superbakterii i nowych wirusw oraz tworzc fenotyp choroby. Dieta o niskiej zawartoci bonnika pokarmowego ze zwikszon zawartoci biaka i tuszczu prowadzi do stymulacji wzrostu endosymbiotykw i kolonii. Archaiki jelita grubego poprzez selekcj naturaln i wymian DNA/genw z innymi organizmami kolonialnymi i endosymbiotycznymi przenosz geny odpornoci na antybiotyki do innej flory jelita grubego. Archaiki jelita grubego generuj rwnie wiroidy RNA, ktre s przeksztacane na wiroidy DNA przez nabonek jelita grubego HERV odwrotn transkryptaz i integrowane z genomem jelita grubego. Wiroidy RNA i DNA hybrydyzuj si z populacj wiroidow i bakteryjn mikrobiomu jelita grubego oraz wirobomowego DNA i RNA jelita grubego, prowadzc do wytworzenia nowych, pojawiajcych si wirusw.