Issledovanie Mekhanizma Organizatsii Spiral'noy Struktury Oligopeptidov

Kak izvestno, vsya informatsiya, neobkhodimaya dlya svorachivaniya belka, soderzhitsya v posledovatel'nosti sostavlyayushchikh ego aminokislotnykh ostatkov. K nastoyashchemu vremeni khorosho izucheny individual'nye kharakteristiki vsekh 20 L-aminokislot (struktura, spektral'nye i termodinamicheskie svoystva), a takzhe svoystva soten peptidov. Izvestna statistika raspredeleniya aminokislot v tekh ili inykh vtorichnykh strukturakh belka, izmereny kineticheskie kharakteristiki ryada stadiy ego svorachivaniya, odnako initsiiruyushchie nachala rannikh stadiy foldinga ostayutsya nedostatochno konkretizirovany. Nasha rabota posvyashchena issledovaniyu nachal'nykh etapov obrazovaniya al'fa-spiraley Polinga-Kori pri pomoshchi sovremennykh metodov komp'yuternogo modelirovaniya: kvantovo-khimicheskogo i molekulyarno-dinamicheskogo. Po nashey gipoteze, spiralizatsiyu initsiiruyut kislye aminokislotnye ostatki - aspartat i glutamat, a terminiruyut osnovnye - arginin, lizin i gistidin. V osnove etikh dvukh protsessov lezhat skhodnye mekhanizmy, khod protekaniya kotorykh my smodelirovali dlya raznykh peptidov i usloviy mikrookruzheniya.